首先，城投公司副总年薪20万有点低，我觉得应该要25万或者30万以上才值得，要不然还不如提拔副科，退休前妥妥的二级主任科员，享受正科级待遇。其次，从题主的提问来看，应该是在县直单位。总的来说，年龄大一点，可以去城投干副总；如果年纪轻一点，最好提拔副科级领导。说说我个人分析。
一、从县乡副科级到县级城投公司当副总，级别没有变化
题主属是预备的副科级，而县级城投公司总经理为正科级，副总经理是副科级，总经理和副总经理等领导班子属于县委组织部管理的企业干部。因此，从县乡副科级到企业副科级，属于平级调动。
二、从县乡副科级到县级城投公司当副总，公务员身份没了
县乡副科级属于公务员身份，而县级城投公司副总属于企业干部身份。县乡副科级到县级国企，身份变为了企业干部，意味着公务员身份没了。在体制内，身份决定一切，身份没了，也就失去了很多提拔的机会和优势。
三、从县乡副科级到县级城投公司当副总，工资待遇极大提高了
以我们县城为例，县乡副科级的局长，加上双边公积金，年终奖等，全年14万元。而县级国企，总经理年薪大概30万，副总大概26万。可知，县级国企副总年薪差不多是县乡副科级的2倍，收入增加不少。
但是题主说你们城投公司的年薪只有20万，我个人觉得这个年薪有点低。以我们县城为例，这个待遇只比副科级公务员高6万元，有些不划算。
四、从县乡副科级到县级城投公司当副总，仕途道路变窄了
县乡40岁副科级，不大不小，不上不下，说没发展，为时过早，如果运气好一点，45岁可以提拔正科，50岁可以提拔副处。说有发展，确实已触摸到提拔晋升的天花板，极有可能在副科级职务上原地踏步、终此一生。
再说到职级并行，县乡副科级，因为有职务优势，退休前解决一级主任科员应该没有问题，享受实打实正科级工资待遇。
而到县城投公司担任副总经理，那就意味着一辈子可能都呆在企业系统，直到退休，而且不太可能提拔正科级的总经理。另外，以题主40岁这个尴尬的年龄，即使有强大外力支持，也不可能再从企业调任行政机关公务员。
五、从县乡副科级到县级城投公司当副总，可能会因为企业效益不好，导致个人工资待遇降低，甚至下岗
目前，部分县级国企经营状况确实不太理想，财务状况堪忧，效益不是很好，极有可能导致企业重组，原来的领导班子成员工资待遇降低，甚至下岗。这也是很多人劝公务员不要到县级国企任职的原因。
但是，县级国企也是国企，也有政府托底，只要不出现较大的风险，国企一般会存在较长的一段时间。即使出现不好的经营状况，政府也会托底，把大家安置好，不至于下岗失去工作。
六、从县乡副科级到县级城投公司当副总，风险大了很多
县城投公司属于县级国企，属于政府投资管理，经营范围主要是“旧城区改造、房地产开发、综合性商业经营、物业管理、产业投资”等项目，这些项目都是政府主导的核心项目，也是需求量比较大热门项目，资金来源大多都是比较可靠的土地转让和地产开发，利润相对来说还是比较高的。以我们县的城投公司为例，每年账户流水资金将近50亿，花出去的钱将近10个亿。可想而知，这里面存在潜在的风险隐患。一不小心，就有可能掉进深渊，万劫不复。作为县里的龙头企业，很多事情身不由己，道理不言而喻。
我们县的城投公司，就有2任老总在即将退休之前被查处，分别被判处10年和12年。
而县乡副科级领导，虽然职业风险隐患和诱惑也比较多，但手中的权力比较有限，加之有制度、人事和党规党纪的约束，只要能够保持一定的清醒，在经济领域一般都不会犯什么大错误。
综上，如果年龄大一点，想领取高工资，不怕承担经济风险的，那就去县城投公司当副总经理。如果年纪轻一点，还想在仕途上有所建树，想往后提拔正科级、副处级，那就选副科级，不要去企业。当然去企业后，公务员身份没了，提拔晋升的空间变得狭窄了，意味着个人政治前途将原地踏步、终此一生了。
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